동원지원단은 국방개혁 기본계획으로 전·평시 동원체계의 혁신적인 전기를 위해 효율적인 동원자원관리 등을 위해 창설됐으며 전시 병력과 물자의 대량 손실이 발생할 것을 대비해 평시 동원예비군의 전투력을 유지하고 필요한 장비와 물자, 탄약 등을 최상의 상태로 관리, 유사시 전방으로 증원하는 임무를 수행하게 된다.

그동안 병력, 장비, 물자 등 각기 다른 개별 보충의 형태에서 지원해주는 기능에 대비하기에는 한계가 있었는데 이창섭(대령) 39동원지원단장은 “우리 39동원지원단을 끝으로 전군 동원지원단 창설이 완료되었다.”며 “국토수호에 대한 열정으로 동원즉응태세 완비에 만전을 기하겠다.”고 각오를 밝혔다.